Dans le souci d'associer plus étroitement les étudiants belges aux travaux de la CUD, l'action-pilote "microprojet" a été initiée en 2006.

Les microprojets sont la concrétisation d'un petit projet dans le Sud, mené par des étudiants d'universités belges en partenariat avec des étudiants d'un pays en développement. Ces projets sont encadrés par un responsable d'activité CUI ou un promoteur PIC afin d'optimaliser le projet en raison du partenariat universitaire préexistant.  

Suite à la diffusion d'un premier appel en 2006, deux projets introduits par des groupes d'étudiants, ont été sélectionnés. Le deuxième appel, lancé en 2007, a quant à lui donné lieu à la réalisation de 4 projets. L’évaluation des projets sélectionnés en 2006 et en 2007 a permis aux appels suivants de mieux cibler les objectifs du programme et le type de projets amené à être sélectionné.

Ainsi, en 2009, 4 projets ont été concrétisés :

• Infections urinaires détectées par tigette et lien avec l’accès à l’eau potable et l’hygiène chez les enfants de 3 à 6 ans du district de Can Gio (Ho Chi Minh Ville, Vietnam)
  En Belgique: Gauthier-Thibaut NOPPE, Nathalie MULS, Christophe GLORIEUX, Lionel MIGNION et Aline DE JAEGERE, UCL
  Partenaires au Vietnam : Hong Phuoc DUONG, Vinh Tai TRAN, Quynh Chau DUONG et Thuy Chau NGUYEN, Université de Médecine Pham Ngoc Thach
  
  Responsables CUI: Annie ROBERT, UCL
• Semer le fruit d’entreprendre avec l’homme intègre
  En Belgique : Grégoire KRIEG, Benjamin PEETERS, Jérémy JEAN et Sheke KITENGE, UCL
  Partenaires au Burkina Faso : Moussa SANGARE, Noufou ZONGO, Sana DAOUDA et Aly BILGO, Université de Ouaga II
  
  Responsable CUI : Marie-Paule KESTEMONT, UCL
• Renforcement, par la construction de dispositifs permettant la réalisation de travaux pratiques, du programme de formation universitaire en technologies solaires dispensé à l’Université de Ouagadougou
  En Belgique : Maxime DELVAUX, Fanny URBAIN, Jérôme STERCKX et Nathalie TEPER ULB
  Partenaires au Burkina Faso : Yaya OUIBGA, Abdoul Moumouni OUEDRAOGO, Sébastien Dramane KONCOLE, Mohamed SINARE, Daniel GOUBA et Joachim OUEDRAOGO, Université de Ouagadougou
  
  Responsable CUI : Marie-Paule DELPLANCKE, ULB
• Modification des attitudes des producteurs et consommateurs de deux zones importantes de production agricole de la région de Cochabamba via une campagne de sensibilisation des enfants et des associations paysannes aux effets des facteurs sol et eau sur la qualité des aliments
  En Belgique : Geoffrey PIETTE, Catherine DEBATTY, Karin MOUVET et Izin OZDEMIR, ULg
  Partenaires en Bolivie : Karen CORDOVA, Katalina LANDEATA, Jaime SALAMANCA, Andrea TORO et Ivar ZAMBRANA, Universidad Simón I. Patiño
  
  Responsable PIC : Jean-Luc GILLES, ULg